Mede door het grote verspreidingsgebied van L. lutra worden er van deze soort een groot aantal ondersoorten onderscheiden [1] Door ITIS wordt ook L. nippon gezien als ondersoort van L. lutra: L. lutra whiteleyi (Gray, 1867) [3]. Genetisch onderzoek door de Kochi Universiteit in Japan aan gemummificeerde exemplaren heeft echter aangetoond dat de Japense otter wel degelijk als aparte soort moet worden gezien.[4]
↑(en) Suzuki , T., Yuasa , H., Machida , Y. (1996). Phylogenetic position of the Japanese river otter Lutra nippon inferred from the nucleotide sequence of 224 bp of the mitochondrial cytochrome b gene. Zoological Science 1996 (13): 621–626. PMID: 8940916. DOI:10.2108/zsj.13.621.