Classificatie en evolutie
Classificatie van organismen, indeling naar evolutionaire afstamming.
Alle organismen op aarde welke "levend" worden genoemd bestaan minimaal uit een cel met celmembraan, een cytoplasma, enzymen (bijna altijd eiwitten) en erfelijk materiaal (dit sluit de virussen uit). Het erfelijk materiaal bestaat uit dubbelstrengs DNA. Volgens de evolutietheorie worden alle organismen (en virussen) verondersteld één gemeenschappelijke voorouder te hebben gehad, die bekendstaat als LUCA (Last Universal Common Ancestor).
Inhoud |
Kenmerken van het leven [bewerken]
Eigenschappen van leven zijn onder andere:
- homeostase: het vermogen van een organisme om het interne milieu constant te houden.
- leven vertoont organisatie en structuur: er is een verband tussen vorm (anatomie, histologie, morfologie) en functie (fysiologie, gedrag). De basale bouwstenen van het leven zijn cellen.
- metabolisme of stofwisseling: het opnemen van energie van het geheel van biochemische processen die plaatsvinden in cellen en organismen ten behoeve van de activiteit, groei, voortplanting en instandhouding. Energie wordt van de ene vorm in de andere vorm getransformeerd.
- groei: het proces van toename van grootte en complexiteit.
- Er vinden aanpassingen plaats in structuren of gedrag, die de organismen beter in staat stellen te overleven of voor nageslacht te zorgen. Dit principe van adaptatie aan het milieu is fundamenteel voor de evolutie van populaties.
- prikkelbaarheid: het kunnen reageren op stimuli, op veranderingen in het uitwendige of inwendige milieu van het organisme.
- voortplanting: het proces waarbij een organisme voor nakomelingen en voor het voortbestaan van de soort zorgt. Voor geslachtelijke voortplanting zijn twee individuen nodig. De nakomeling hebben kenmerken van beide ouders in nieuwe combinaties.
Taxonomie [bewerken]
De oude indeling van de eukaryoten in planten en dieren is geleidelijk losgelaten. In de jaren 60 van de 20e eeuw werden eerst de schimmels (Fungi) als aparte groep erkend, later werden nog vele andere groepen organismen naast de planten, dieren en schimmels geplaatst omdat uit studie bleek dat het onhoudbaar was om bepaalde organismen binnen één van die drie groepen te houden. Voorbeelden zijn de roodwieren (uit de plantengroep gehaald) en de slijmzwammen (lijken slechts oppervlakkig op schimmels en zijn uit de Fungi gehaald).
Veel oudere groepsnamen zoals monera, prokaryoten, protisten of protoctista worden nog om praktische redenen gebruikt. Ze komen nog veel voor in bestaande literatuur en op websites, maar worden in de moderne taxonomie niet meer gebruikt. Een classificatie wordt geacht de evolutie van de organismen te weerspiegelen. Onderstaande indeling is naar recente inzichten. Een goede indeling moet monofyletisch zijn. Door enkele onduidelijkheden in de afstamming is onderstaande indeling nog niet geheel monofyletisch[1].
| Haeckel (1894) 3 rijken |
Whittaker (1969) 5 rijken |
Woese (1977) 6 rijken |
Woese (1990) 3 domeinen |
Cavalier-Smith (1998) 2 domeinen en 6 rijken |
Keeling (2004) 3 domeinen en 5 supergroepen |
||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Animalia | Animalia | Animalia | Eukarya | Eukaryota | Animalia | Eukaryota | Unikonta |
| Plantae | Fungi | Fungi | Fungi | Excavata | |||
| Plantae | Plantae | Plantae | Archaeplastida | ||||
| Protista | Protista | Chromista | Chromalveolata | ||||
| Protista (niet behandeld door Linnaeus) |
Protozoa | Rhizaria | |||||
| Monera | Archaebacteria | Archaea | Prokaryota | Bacteria | Archaea | ||
| Eubacteria | Bacteria | Bacteria | |||||
'Domein' van de virussen [bewerken]
Virussen worden strikt genomen niet als "levend" beschouwd, omdat enkele belangrijke kenmerken van het leven ontbreken. Wel zijn ze verwant aan organismen en vertonen ze evolutie, die zelfs sneller kan verlopen dan bij organismen. Een virus is een stukje erfelijk materiaal verpakt in enkele eiwitten. Een virus is (dan wel heeft) geen cel met enzymen die voor de groei en vermenigvuldiging zorgen. Voor vermenigvuldiging is een virus volledig afhankelijk van een gastheercel. De gastheercel maakt nieuwe virusdeeltjes. Vanuit deze optiek gezien is een virus de ultieme parasiet.
Afhankelijk van de manier waarop een virus zijn erfelijk materiaal (DNA of RNA) vermenigvuldigt kan ook de volgende kunstmatige indeling in drie groepen worden gemaakt:
- "Domein" Virussen (niet-cellulair, plaats onduidelijk, parafyletisch)
- DNA Virusen
- Dubbelstrengs DNA virusen (dsDNA, 22 families)
- Enkelstrengs DNA virusen (ssDNA, 6 families)
- Reverse-transcriptase virusen
- Dubbelstrengs DNA reverse-transcriptase virusen (dsDNA-RT, 2 families)
- Enkelstrengs DNA reverse-transcriptase virusen (ssDNA-RT, 3 families)
- RNA Virusen
- Dubbelstrengs RNA viruses (dsRNA, 7 families)
- Negatief-strengs enkelstrengs RNA virusen (-ssRNA, 7 families)
- Positief-strengs enkelstrengs RNA virusen (+ssRNA, 24 families)
- Subvirale agentia
- DNA Virusen
Domein Eubacteria [bewerken]
- Domein Eubacteria = Bacteriën[2]
- Rijk Proteobacteriae
- Rijk Spirochaetae
- Rijk Oxyphotobacteriae met 1 stam: Cyanobacteria = Blauwalgen
- Rijk Saprospirae
- Rijk Chloroflexae
- Rijk Chlorosulfatae
- Rijk Pirellae met 1 stam: Pirellobacteria
- Rijk Firmicutae
- Rijk Thermotogae
Domein Archaea [bewerken]
- Domein Archaea
- Rijk Euryarchaeota
- Rijk Crenarchaea
Domein Eukaryota [bewerken]
Het domein Eukarya (Eukaryoten) omvat 5 supergroepen.
Supergroep Unikonta [bewerken]
- Supergroep Unikonta
- clade Opisthokonta
- Rijk Animalia = Dieren = Metazoa
- Stam Choanoflagellata
- Stam Parazoa
- Stam Radiata
- clade Bilateria
- clade Protostomata
- clades Lophotrochozoa, Paracoelomata, Ecdysozoa
- clade Deuterostomata
- Stam Hemichordata
- Stam Echinodermata
- Stam Urochordata
- Stam Cephalochordata
- Stam Craniata
- clade Protostomata
- Rijk Fungi = Schimmels
- Stam Microsporidia
- Stam Chytridiomycota
- Stam Neocallimastigomycota
- Stam Blastocladiomycota
- clade Zygomycota
- Stam Euzygomycota
- Stam Parazygomycota
- Stam Glomeromycota
- clade Dikaryomycota
- Stam Ascomycota
- Stam Basidiomycota
- Rijk Animalia = Dieren = Metazoa
- Rijk Amoebozoa = Amoeben
- Stam Wortelpotigen = Rhizopoda
- Stam Myxomycota
- Stam Dictyostela
- ? Stam Apusozoa[3]
- clade Opisthokonta
Supergroep Excavata [bewerken]
- Supergroep Excavata
- Rijk Euexcavata
- Stam Carpediemonada
- Stam Jakobada
- Stam Eophyringa
- Stam Metamonada
- Stam Parabasala
- Rijk Discicristatae
- Stam Euglenoida
- Stam Diplonemida
- Stam Kinetoplasta
- Stam Heterolobosa
- Stam Pseudociliata
- Rijk Euexcavata
Supergroep Chromalveolata [bewerken]
- Supergroep Chromalveolata
- Rijk Eukaryomonadae = Hacrobia
- Stam Cryptomonadae = Cryptophyta
- Stam Haptophyta = Haptomonadae = Prymnesiophyta
- Stam Centrohelomonada
- Rijk Heterokontae = Stramenopiles = Chromista
- Stam Opalinida
- Stam Labyrinthulomorpha
- Stam Bicosoecida
- Stam Oomycota = Waterschimmels
- Stam Chrysophyta
- Stam Actinophryida
- Stam Raphidiophyta
- Stam Xanthophyta
- Stam Eustigmatophyta
- Stam Phaeophyta
- Stam Bacillariophyta = Diatomeeën
- Rijk Alveolatae
- Stam Dinoflagellaten
- Stam Ciliata = Ciliophora
- Stam Apicomplexa = Sporozoa
- Rijk Eukaryomonadae = Hacrobia
Supergroep Rhizaria [bewerken]
- Supergroep Rhizaria
- Rijk Cercozoae
- Stam Cercomonada
- Stam Chlorarachniophyta
- Stam Phytomyxa
- Stam Granuloreticulosa = Foraminifera
- Stam Haplosporidia
- Stam Radiolaria
- Rijk Cercozoae
Supergroep Archaeplastida [bewerken]
- Supergroep Archaeplastida = Primoplantae
- Rijk Rhodoplantae
- Stam Rhodophyta
- Stam Cyanidiophyta
- Stam Glaucophyta
- Rijk Viridiplantae = Chloroplastida = Chlorobiota = Chlorobionta ~ Planten
- Stam Prasinophyta
- Stam Chlorophyta
- Stam Charophyta = Kranswieren
- clade Embryophyta, Landplanten
- Stam Hepatophyta
- Stam Anthocerotophyta = Hauwmossen
- Stam Bryophyta = Bladmossen
- clade Tracheophyta
- † Stam Rhyniophyta
- † Stam Zosterophyllophyta
- † Stam Trimerophyta
- Stam Lycopodophyta, (met Wolfsklauwen en Paardestaarten)
- Stam Pteridophyta = Varens
- † Stam Progymnospermophyta
- clade Spermatophyta = Fanerogamen = Zaadplanten
- † Stam Pteridospermophyta = Zaadvarens
- Stam Cycadophyta = Palmvarens
- † Stam Cycadeoidophyta
- Stam Ginkgophyta
- Stam Coniferophyta = Coniferen
- Stam Gnetophyta (met Gnetum, Ephedra en Welwitschia)
- Stam Angiospermophyta = Bedektzadigen = Anthophyta = Bloemplanten[4]
- Rijk Rhodoplantae
Zie ook [bewerken]
Bronnen, noten en/of referenties
|