Dit seizoen namen er 5957 clubs deel. De competitie ging in de zomer van 1998 van start en eindigde op 15 mei 1999 met de finale in het Stade de France in Saint-Denis. De finale werd gespeeld tussen FC Nantes (voor de zevende keer finalist) en CS Sedan (voor de vierde keer finalist). FC Nantes veroverde voor de tweede keer de beker door CS Sedan met 1-0 te verslaan.
Als bekerwinnaar nam FC Nantes in het seizoen 1999/2000 deel in de UEFA Cup.
De 18 clubs van de Division 1 kwamen in deze ronde voor het eerst in actie. De wedstrijden werden op 23 en 24 januari en 9 februari (2e wedstrijd tussen St.Germain-Thouars) gespeeld.
* = thuis; ** drie wedstrijden werden op neutraal terrein gespeeld; *** 1e wedstrijd (in Angers) werd na 67 minuten afgebroken vanwege dichte mist, de 2e wedstrijd werd in Poitiers gespeeld.
De wedstrijd werd op 15 mei 1999 gespeeld in het Stade de France in Saint-Denis voor 78.586 toeschouwers. De wedstrijd stond onder leiding van scheidsrechter Pascal Garibian.