Desoxyribonuclease

Uit Wikipedia, de vrije encyclopedie
Ga naar: navigatie, zoeken
Kristallen van het DNase proteïne.

Desoxyribonuclease (DNase, afgekort) is een enzym en onderdeel van de groep nucleasen die de degradatie van desoxyribonucleïnezuur of DNA katalyseren. Desoxyribonuclease is een hydrolase; een enzym dat de een chemische binding genaamd fosfodi-esterbinding hydrolyseert; zonder uiteindelijk deel te nemen aan de reactie. Daarom behoort desoxyribonuclease tot de groep katalysatoren

Er zijn een groot aantal desoxyribonucleasen bekend die verschillen in biologisch substraat, chemische reactiemechanismen en biologische functies. Desoxyribonucleasen komen in alle levende wezens voor en zijn een wezenlijk van de stofwisseling in een cel.

Reactiewijzen[bewerken]

Sommigen DNasen maken geen onderscheid welke gedeelte van de DNA keten doorgeknipt worden. Andere DNasen daarentegen maken wel onderscheid, soms in combinatie met een restrictie-enzym, en knippen zeer specifieke genen los. Genen bestaan uit een aantal nucleotiden die in een bepaalde volgorde of sequenties met elkaar zijn verbonden. Het handelt hier om DNasen die zowel enkel- als dubbelstrengig DNA hydrolyseren en sommigen beiden.

DNase enzymen kunnen via een verstuiver ingeademd worden. Het is een behandelmethode voor patiënten die lijden aan taaislijmziekte. DNase enzymen helpen door de samengeklonterde witte bloedcellen in het slijm af te breken. Het DNA, dat vrijkomt nadat de cel is afgebroken, is vrij plakkerig. De DNase zorgt ervoor dat het DNA wordt afgebroken en zo kan het slijm eenvoudiger uit de longen verdwijnen.

Type desoxyribonucleasen[bewerken]

Desoxyribonucleasen in levende wezens, de metazoa, worden onderverdeeld in endonucleasen en exonucleasen. Er zijn verscheidene klassen en subklassen van bekend die vallen onder het EC-nummer 2.7 (forforolyische enzymen) en EC-nummer 3.1 (hydrolytische enzymen) enzymklassen. De 'International Union of Biochemistry and Molecular Biology' [1] heeft de EC-nummers 3.1.26.- en 3.1.27.- gereserveerd voor de endonucleasen en de EC-nummers 3.1.13.- en 3.1.14.- voor exonucleasen. Terwijl er nog weinig nucleasen bekend zijn die zowel RNA als DNA hydrolyseren, EC-nummers (3.1.15.- en 3.1.16.-). Het handelt hier om zowel enkel- als dubbelstrengig DNA, hierin wordt geen onderscheid gemaakt in de indeling van DNase. De twee hoofdgroepen DNases zijn desoxyribonuclease I en desoxyribonuclease II. Een ander type is het DNase Micrococcal nuclease.

Eigenschappen van desoxyribonucleasen[bewerken]

DNA absorbeert UV-licht met een golflengte van 260 nm. Het Uv-licht wordt geadsorbeerd door de pi-elektronen in de aromatische basen van DNA. Deze eigenschap wordt gebruikt om de eenheid Kunitz te definiëren. Een Kunitz eenheid wordt gedefinieerd als de hoeveelheid enzym dat wordt toegevoegd aan 1 milligram/ 1 milliliter DNA en een toename in absorbatie van 0,001 per minuut veroorzaakt van de golflengte 260 nm bij 25°C in een 0.1 Molaire buffer van NaOAc (pH 5.0). De naam van deze eenheid is een erkenning van de Russisch-Amerikaanse biochemicus M. Kunitz, die deze standaardtest in 1946 voorstelde.

Numeriek Classificatie Systeem[bewerken]

Desoxyribonucleasen zijn volgens het enzymclassificatiesysteem van het "Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology" (NC-IUBMB) ingedeeld onder de hydrolasen (EC-nummer 3). De desoxyribonucleasen behoren samen met de fosfodiësterases, lipases en fosfatases tot de esterases (EC-nummer 3.1), een ondergroep van de hydrolasen. Ze breken esters af. De esterasen waartoe de desoxyribonucleasen behoren en die nucleïnezuren afbreken, worden ingedeeld in de groepen EC-nummer 3.1.11 - EC-nummer 3.1.31.


Referenties[bewerken]

  1. IUBMB: Homepage van de IUBMB (Definition, engl.)