In 1977 ging Yamamoto naar de Kokushikan University, waar hij in het schoolteam voetbalde. Nadat hij in 1981 afstudeerde, ging Yamamoto spelen voor Yamaha Motors. Yamamoto veroverde er in 1982 de Beker van de keizer. In 6 jaar speelde hij er 109 competitiewedstrijden en scoorde 3 goals. Yamamoto beëindigde zijn spelersloopbaan in 1987.