De club ontstond in 1995 als New York/New Jersey MetroStars. Het was een van de tien clubs die deelnamen aan het eerste seizoen van de MLS. In dit eerste seizoen kwamen de spelers op het veld in een uitrusting met zwart en witte verticale strepen. Vanaf het tweede seizoen veranderde dit in rood en zwart. Na het tweede seizoen werd NY/NJ uit de clubnaam verwijderd, wat het een van de weinige Amerikaanse sportclubs maakte zonder plaatsnaam in de eigen naam.
Door het aantrekken van een aantal Europese voetbalsterren zoals Roberto Donadoni en Lothar Matthäus, werd verwacht dat de Metrostars de competitie zouden domineren. Het team werd echter geen groot succes, het kon geen enkele nationale prijs winnen.
Toen Red Bull de Metrostars in 2006 kocht, besloot het om het team te restylen. Zowel de naam, de kleuren en het logo werd een nieuw pakje aangemeten, met nadruk op de nieuwe investeerder. Het omvormen van de Metrostars tot Red Bull New York zorgde voor grote controverse onder de fans, net zoals in Oostenrijk, waar Red Bull SV Austria Salzburg had herdoopt tot Red Bull Salzburg.
Sinds het seizoen 2010-2011 speelt Red Bull New York in de Red Bull Arena. Dit stadion biedt plaats aan 25.189 toeschouwers. Op 19 september 2006 is men begonnen met de bouw van het stadion. Het stadion werd op 20 maart 2010 officieel geopend met een vriendschappelijke wedstrijd tegen het Braziliaanse team Santos FC. De wedstrijd eindigde met een 3-1-overwinning. De eerste competitiewedstrijd werd gehouden op 27 maart 2010 tegen Chicago Fire. Ook dit leverde een overwinning op, de Red Bulls wonnen met 1-0.
Vanaf 1996 tot 2009 speelde de club in het Giants Stadium. Dit stadion had een capaciteit van 80.200 toeschouwers. Doordat het stadion eigenlijk een American Football stadion is, heeft de club op 5 augustus 2005 besloten om te gaan verhuizen naar een volwaardig voetbalstadion. Het stadion zou de werktitel Red Bull Park meekrijgen, later werd dit gewijzigd naar Red Bull Arena.
Red Bull GmbH
Chris Armas
Zie ook: Red Bull Arena
.svg){kind=small}
Giovanni Savarese (14)
Niet bekend (-)
Amado Guevara (11)
Juan Pablo Ángel (19)
Hans Backe
Juan Carlos Osorio
Mo Johnston
Octavio Zambrano
Bora Milutinović
Alfonso Mondelo
Carlos Alberto Parreira
Carlos Queiroz
Eddie Firmani
· 
· 
· 