Deze etappe was een van de zwaarste bergritten van de ronde. Zowel de lengte, het aantal bergen en de steiltepercentages zullen ervoor zorgen dat deze rit een belangrijke rol voor het eindklassement zal spelen. Bovendien was het de laatste bergrit en dus hadden klimmers die nog doelen hadden in het klassement of nog geen ritzege hadden hier hun laatste kans. De finish lag op de bekende Col d'Aubisque, een legendarische Tourcol. In totaal stonden er 5 beklimmingen op het programma: 2 van de buitencategorie (HC), 2 van de 1e categorie en 1 van de 3e categorie.
Bij de Kazach Aleksandr Vinokoerov werd bij de dopingcontrole bloeddoping geconstateerd, de uitslag van de contra-expertise gaf hetzelfde resultaat. Vinokoerov werd geschorst door de leiding van zijn wielerploeg Astana en na overleg met de Tourdirectie werd tijdens de rustdag na de vijftiende etappe besloten de gehele niet meer in de zestiende etappe te laten vertrekken.[1] Aan het einde van de rit werd bekend dat Cristian Moreni tijdens de 11e etappe doping had gebruikt. Daarom werd ook hij uit de Tour gezet en besloot zijn wielerploeg Cofidis zich ook uit de tour te trekken.
Tijdens de 16e etappe ging de route door het Spaanse Baskenland. Nadat het peloton was gepasseerd, gingen er twee kleine bommen af die waren geplaatst door de ETA. Er vielen geen gewonden en de renners merkten zelfs niet of nauwelijks iets van de aanslagen[3].
.svg){kind=small}
Denemarken
Verenigde Staten
Spanje
Australië
Colombia
· 
· 