Janočko kwam in totaal 42 keer (drie doelpunten) uit voor het Slowaaks voetbalelftal in de periode 1999-2006[2]. Hij maakte zijn debuut op 4 september1999 in de EK-kwalificatiewedstrijd in Bratislava tegen Roemenië, die met 5-1 werd verloren, onder meer door twee treffers van de Roemeense spits Viorel Moldovan.