Dendrogram

Uit Wikipedia, de vrije encyclopedie
Naar navigatie springen Naar zoeken springen

Een dendrogram is een boomstructuur-diagram. Dendrogrammen worden vaak gebruikt in biologische en biochemische studies om weer te geven hoe genen zich clusteren. Deze clusters worden geproduceerd door een clusteralgoritme (clusteranalyse). In een dendrogram wordt weergegeven hoe en waar de clusters zich ten opzichte van elkaar bevinden ofwel zijn geplaatst. Het dendrogram geeft bijvoorbeeld een beeld van de verwantschappen tussen soorten.

Voorbeeld[bewerken | brontekst bewerken]

In het volgende voorbeeld clustert men de ruwe data op basis van de Euclidische afstand:

De ruwe data.

Clusters.PNG

Voorbeeld van een dendrogram.

Hierarchical clustering diagram.png

Weergave in een cladogram
 clade [abcdef

a


 clade [bcdef
 clade [bc

b



c



 clade [def
 clade [de

d



e




f





Alternatieve weergaven in een cladogram
  • abcdef
    • a
    • bcdef
      • bc
        • b
        • c
      • def
        • de
          • d
          • e
        • f
    • a
        • b
        • c
          • d
          • e
        • f