Onder leiding van bondscoach Bojan Prašnikar maakte Ačimovič zijn debuut voor het Sloveens voetbalelftal op 22 april1998 in de vriendschappelijke interland tegen Tsjechië (1-3). Hij viel in dat duel na 68 minuten in voor Miran Pavlin. Ačimovič speelde in totaal 74 interlands, en scoorde dertien keer voor zijn vaderland. Hij nam met Slovenië deel aan het EK voetbal 2000 en het WK voetbal 2002. Bij dat laatste toernooi scoorde hij tegen Paraguay.