Zuid-Soedan nam deel aan de Olympische Zomerspelen 2020 in Tokio, Japan. Het land deed voor de tweede keer mee aan de spelen. Net als de eerste keer won Zuid-Soedan geen medailles. Naast de atleten die voor Zuid-Soedan uitkwamen namen er nog vier atleten uit het land deel onder de vlag van het vluchtelingenteam.