Vanwege zijn dubbele nationaliteit kon Bougherra kiezen of hij voor Algerije of voor Frankrijk wilde uitkomen. Voor het Algerijns elftal debuteerde hij op 20 juni 2004 tegen Zimbabwe. Hij maakte zijn eerste interlanddoelpunt op 2 juli 2007 tegen Kaapverdië. Op 2 juni werd hij opgenomen in de selectie voor het wereldkampioenschap voetbal 2014 in Brazilië door bondscoach Vahid Halilhodžić.[2]