De Russische voetbalbeker 2006/07 (Russisch: Кубок России по футболу 2006/07) was de 15de editie van de strijd om de Russische voetbalbeker sinds de ontmanteling van de Sovjet-Unie. Het toernooi telde 119 deelnemende clubteams en begon op 13 april2006 met de voorronde. De finale werd gespeeld op 27 mei2007 in het Olympisch Stadion Loezjniki in Moskou. De eindstrijd werd geleid door scheidsrechter Yuriy Baskakov. Onder leiding van trainer-coach Anatoliy Byshovets won Lokomotiv Moskou de beker voor de vijfde keer in de clubgeschiedenis, ten koste van FK Moskou (0-1) ditmaal. Het beslissende doelpunt kwam in de verlenging op naam van de Schotse invaller Garry O'Connor.