Naar inhoud springen

Bestand:TET-mediated DNA modifications and demethylation.png

Pagina-inhoud wordt niet ondersteund in andere talen.
Uit Wikipedia, de vrije encyclopedie

Oorspronkelijk bestand(1.587 × 1.115 pixels, bestandsgrootte: 358 kB, MIME-type: image/png)


Beschrijving

Beschrijving

FIGURE 1. TET-mediated DNA modifications and demethylation. (A) Unmodified cytosine (C) is methylated by DNA methyltransferases (DNMTs) at the 5 position to become 5-methylcytosine (5mC). TET proteins oxidize 5mC into 5-hydroxymethylcytosine (5hmC), a stable epigenetic mark, and subsequently to 5-formylcytosine (5fC) and 5-carboxylcytosine (5caC). TET can demethylate DNA via replication-dependent (passive) or replication-independent (active) mechanisms. (B) Left, passive DNA demethylation. DNMT1/UHRF1 complex recognizes 5mC at the hemi-methylated CpG motif during DNA replication and methylates the unmodified cytosine on the newly synthesized DNA strand (left; pink strand). However, the oxidized ethylcytosines 5hmC, 5fC, and 5caC (together, oxi-mC) are not recognized by DNMT1/UHRF1, resulting in unmodified cytosine on the new DNA strand. Further DNA replication in the presence of continuing TET activity will result in progressive dilution of 5mC in the daughter cells. Right panel, active DNA demethylation. While 5hmC is stable and persists in the genome, 5fC and 5caC can be recognized and excised by thymine DNA glycosylase (TDG), and the resulting abasic sites are repaired as unmodified C by base excision repair (BER). Other mechanisms (e.g., decarboxylation of 5caC) have been suggested but have not yet been proven to exist. (C) The approximate abundance of unmodified and modified cytosines in the haploid human/mouse genome. About 5% of cytosine is methylated (5mC); in most cells, the vast majority of 5mC is present at CG dinucleotides although it is low at

CpG islands. 5hmC amounts to about 1-10% of 5mC (estimated at 10% here as in embryonic stem cells), while the levels of 5fC and 5caC are each about an order of magnitude lower than the previous oxidative modification. It is not known whether the low levels of 5fC and 5caC are due to features of TET enzymes that cause them to arrest at 5hmC, or to their continuing removal by TDG or other mechanisms.
Datum
Bron

https://www.researchgate.net/publication/331043443_TET_Enzymes_and_5hmC_in_Adaptive_and_Innate_Immune_Systems TET

Enzymes and 5hmC in Adaptive and Innate Immune Systems. Front. Immunol. 10:210 doi: 10.3389/fimmu.2019.00210
Auteur Lio C-WJ and Rao A
Dit bestand, dat oorspronkelijk toegevoegd was op een externe website, is nog niet beoordeeld door een moderator of reviewer om te bevestigen dat de opgegeven licentie geldig is. Zie Category:License review needed voor meer instructies.

Copyright © 2019 Lio and Rao. This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License (CC BY). The use, distribution or reproduction in other forums is permitted, provided the original author(s) and the copyright owner(s) are credited and that the original publication in this journal is cited, in accordance with accepted academic practice. No use, distribution or reproduction is permitted which does not comply with these terms.

Licentie

w:nl:Creative Commons
naamsvermelding
Dit bestand is gelicenseerd onder de Creative Commons Naamsvermelding 4.0 Internationaal licentie.
De gebruiker mag:
  • Delen – het werk kopiëren, verspreiden en doorgeven
  • Remixen – afgeleide werken maken
Onder de volgende voorwaarden:
  • naamsvermelding – U moet op een gepaste manier aan naamsvermelding doen, een link naar de licentie geven, en aangeven of er wijzigingen in het werk zijn aangebracht. U mag dit op elke redelijke manier doen, maar niet zodanig dat de indruk wordt gewekt dat de licentiegever instemt met uw werk of uw gebruik van zijn werk.

Bijschriften

Beschrijf in één regel wat dit bestand voorstelt

Items getoond in dit bestand

beeldt af

Bestandsgeschiedenis

Klik op een datum/tijd om het bestand te zien zoals het destijds was.

Datum/tijdMiniatuurAfmetingenGebruikerOpmerking
huidige versie23 mei 2024 23:17Miniatuurafbeelding voor de versie van 23 mei 2024 23:171.587 × 1.115 (358 kB)Rasbak{{Information |description= FIGURE 1. TET-mediated DNA modifications and demethylation. (A) Unmodified cytosine (C) is methylated by DNA methyltransferases (DNMTs) at the 5 position to become 5-methylcytosine (5mC). TET proteins oxidize 5mC into 5-hydroxymethylcytosine (5hmC), a stable epigenetic mark, and subsequently to 5-formylcytosine (5fC) and 5-carboxylcytosine (5caC). TET can demethylate DNA via replication-dependent (passive) or replication-independent (active) mechanisms. (B) Left, pas...

Dit bestand wordt op de volgende 2 pagina's gebruikt:

Metadata