Het bisdom Dubuque werd op 28 juli 1837 afgesplitst van het bisdom Saint Louis. Het was suffragaan aan het aartsbisdom Baltimore. Op 20 juli 1847 ging het bisdom over naar het tot metropolitaan aartsbisdom verheven Saint Louis. Op 19 juli 1850 werden delen van Saint Louis en Dubuque samengevoegd tot het nieuwe bisdom Saint Paul. Op 14 juni 1881 volgde de afsplitsing van het bisdom Davenport. Op 15 juni 1893 werd Dubuque door paus Leo XIII tot metropolitaan aartsbisdom verheven. Op 15 januari 1902 werd gebied afgestaan voor het nieuwe bisdom Sioux City.