In 1978 ging Nakamoto naar de Chuo University, waar hij in het schoolteam voetbalde. Nadat hij in 1982 afstudeerde, ging Nakamoto spelen voor Nippon Kokan, de voorloper van NKK. Nakamoto veroverde er in 1987 de JSL Cup. Nakamoto beëindigde zijn spelersloopbaan in 1991.