De club werd in 1977 opgericht als Metālists Jelgava en als RAF Jelgava en won driemaal de Letse beker sinds de onafhankelijkheid. Na financiële problemen kreeg de club een bod van de universiteit van Riga en verhuisde naar Riga en nam de naam Universitāte Rīga aan. Sinds 2001 speelt de club weer in Jelgava; eerst weer als RAF Jelgava, vanaf 2004 onder de huidige naam.
Voor het seizoen 2021 ontving de club geen licentie voor de Virsliga. Het speelde als FS Jelgava in de 1. līga en werd daar kampioen. Toen kon het wel weer een licentie voor het hoogste niveau behalen.
Māris Peilāns
Jozef Skrlik
Zie Lijst van Europese wedstrijden van FK Jelgava voor het hoofdartikel over dit onderwerp.
· 
· 