De vorig seizoen bedachte formats keerden dit seizoen terug. Zo werd er twee zogenaamde penaltyraces worden georganiseerd, hierbij wordt er geen tijdsachterstand berekend voor het langlaufen maar een achterstand in meters. Afhankelijk van het ontstane verschil na het schansspringen moeten de atleten een bepaalde afstand extra afleggen. Daarnaast bestond de slotwedstrijd, met de beste dertig van het wereldbekerklassement, uit twee sprongen en 15 kilometer langlaufen. Het gros van de wedstrijden bestond echter nog altijd uit één sprong van de schans gevolgd door 10 kilometer langlaufen. Op het programma stonden ook zes teamwedstrijden. Twee daarvan waren een klassieke teamwedstrijd, vier sprongen vanaf de schans gevolgd door vier keer 5 kilometer langlaufen. Daarnaast stond er vier keer een zogenaamde teamsprint op het programma, waarbij een team van twee atleten zes keer 2,5 kilometer moet langlaufen, nadat beiden eenmaal van de schans hebben gesprongen.
De FIS organiseerde enkel een wereldbeker voor mannen. De Duitser Eric Frenzel won de algemene wereldbeker.
Wereldbeker 2012/2013
Eric Frenzel
FRA
JPN
AUT
NOR
Verenigde Staten
Tsjechië
Slovenië
Finland
Italië
· 
· 