Kilian Nikiema speelde tot 2016 in de jeugd van Voorschoten '97. Sinds 2016 speelt hij in de jeugd van ADO Den Haag, waar hij in 2019 een contract tot medio 2022 tekende.[3]
Nikiema is de zoon van een Burkinese vader en een Nederlandse moeder. Zodoende speelde hij van 2017 tot 2018 voor Nederlandse vertegenwoordigende jeugdelftallen, en kon hij ook in 2019 voor het Burkinees voetbalelftal geselecteerd worden. Hij debuteerde voor Burkina Faso op 4 september 2019, in de met 1-0 gewonnen vriendschappelijke wedstrijd tegen Libië. Hij begon in de basis, en hield de hele wedstrijd de nul.