Afyonkarahisarspor was het resultaat van een fusie tussen Afyon Şekerspor en Afyonspor. Twee jaar na de fusie promoveerde de club al van de Türkiye Futbol Federasyonu 3. Lig naar de Türkiye Futbol Federasyonu 2. Lig. Afyonkarahisarspor trok zich in 2013 terug van de Bölgesel Amatör Lig, het regionaal amateurniveau van het Turkse voetbal en sloot zijn deuren.[2]