SønderjyskE Håndbold behoort bij de vrouwen tot de zwakkere teams in de GuldBageren Ligaen en heeft een geschiedenis van afwisselende promotie uit de eerste en degradatie uit de eredivisie. In seizoen 08/09 trad het na twee jaar afwezigheid opnieuw toe tot de GuldBageren Ligaen, maar eindigde op de voorlaatste plaats waardoor het nacompetitie moet spelen om zich hierin te handhaven. In 2015-16 speelt de ploeg zowel bij de vrouwen als de mannen in de hoogste klasse.