Afobe kwam uit voor Engeland -16, Engeland -17, Engeland -19 en Engeland -21. Voor Engeland -21 scoorde hij meteen bij zijn debuut. Op 13 november 2012 maakte de aanvaller de 2-0 tegen Noord-Ierland -21, nadat hij na een uur inviel voor Andros Townsend.
Afobe werd op 16 maart 2016 opgeroepen voor het voetbalelftal van DR Congo voor twee kwalificatieduels voor de Afrika Cup 2017. Afobe, die ook voor het voetbalelftal van DR Congo mag uitkomen omdat zijn ouders uit dit land komen, accepteerde deze uitnodiging.