Koenen speelde vier seizoenen als centrale middenvelder bij N.E.C.. In 1980 tekende hij een tweejarig contract bij Newcastle United dat in de First Division speelde. Na een zware blessure verliet hij die club na één jaar. Nadat hij kort bij De Treffers gespeeld had, werd hij wederom prof in België bij KFC Diest. Hierna speelde hij nog bij Vitesse en wederom De Treffers voor hij afsloot bij GVVV.