Jordy Huybers speelde in de jeugd van SV Rood-Wit Veldhoven, VV UNA en FC Eindhoven. Sinds 2021 maakt hij deel uit van de selectie van Eindhoven. Hij debuteerde voor dit team op 23 augustus 2021, in de met 3-2 verloren uitwedstrijd tegen Jong PSV. Hij kwam in de 82e minuut in het veld voor Dave de Meij. In de eerste seizoenshelft van het seizoen 2021/22 kwam hij tot vijf invalbeurten.