Mastomys pernanus is een knaagdier uit het geslachtMastomys dat voorkomt in Rwanda, Noord-Tanzania en Zuidwest-Kenia. De verwantschappen van deze soort zijn onduidelijk: in vroegere classificaties werd hij soms in Myomys geplaatst, latere morfometrische analyses gaven aan dat het mogelijk een zeer kleine Mastomys-soort is, en recente genetische gegevens geven aan dat de soort verwant is aan Hylomyscus en Heimyscus. Mogelijk moet de soort in Hylomyscus of in een nieuw geslacht worden geplaatst.