Amelie Hoendermis werd geboren in Appingedam, maar verhuisde al op twaalfjarige leeftijd naar Groningen. Hier ging ze voor Be Quick 1887 spelen.[1] Vanaf 2018 tot 2021 doorliep ze meerdere jeugdteams van de Groningers.[2]
In 2021 mocht Hoendermis stage komen lopen bij sc Heerenveen.[3] Dit resulteerde in dat ze in het seizoen 2022/23 mocht aansluiten bij de eerste selectie van sc Heerenveen.
Op 16 september 2022 maakte Hoendermis haar debuut voor sc Heerenveen in de Vrouwen Eredivisie in een uitwedstrijd tegen PSV door in de 91ste minuut in te vallen voor Nina Nijstad.[4] Vervolgens kwam Hoendermis dat seizoen nog negen keer in actie. In een uitwedstrijd tegen FC Twente had ze haar eerste basisplaats.[5]
Voorafgaande aan het seizoen 2023/24 maakte Hoendermis de overstap naar PEC Zwolle. Hier maakte ze in haar debuutseizoen deel uit van het team van Jong PEC Zwolle.[6]