Dendrogram

Uit Wikipedia, de vrije encyclopedie
Dit is een oude versie van deze pagina, bewerkt door PAvdK (overleg | bijdragen) op 26 mei 2019 om 14:58. (→‎Voorbeeld: aanpassing)
Deze versie kan sterk verschillen van de huidige versie van deze pagina.

Een dendrogram is een boomstructuur-diagram. Dendrogrammen worden vaak gebruikt in biologische en biochemische studies om weer te geven hoe genen zich clusteren. Deze clusters worden geproduceerd door een clusteralgoritme (clusteranalyse). In een dendrogram wordt weergegeven hoe en waar de clusters zich ten opzichte van elkaar bevinden ofwel zijn geplaatst. Het dendrogram geeft bijvoorbeeld een beeld van de verwantschappen tussen soorten.

Voorbeeld

In het volgende voorbeeld clustert men de ruwe data op basis van de Euclidische afstand:

De ruwe data.

Voorbeeld van een dendrogram.

Weergave in een cladogram
 clade abcdef 

a


 clade bcdef 
 clade bc 

b



c



 clade def 
 clade de 

d



e




f





Alternatieve weergaven in een cladogram
  • clade abcdef
    • a
    • clade bcdef
      • clade bc
        • b
        • c
      • clade def
        • clade de
          • d
          • e
        • f
    • a
        • b
        • c
          • d
          • e
        • f