Boeckx was vijf jaar doelman van Sint-Truiden en 5,5 jaar bij KAA Gent. Met de komst van Matz Sels en nieuwbakken coach Mircea Rednic in het seizoen 2013-2014 werd hem duidelijk gemaakt dat hij geen toekomst meer had bij Gent. Boeckx' rugnummer werd overgenomen door Sels en hij werd naar de B-kern verwezen.
Boeckx vertrok in januari 2014 bij KAA Gent en zat een half jaar zonder club, maar tekende in september 2014 een contract bij Antwerp FC.[1] Na een jaar in tweede klasse bij Antwerp FC transfereerde hij als derde doelman naar RSC Anderlecht, waar hij een contract voor één seizoen kreeg.[2] In zijn eerste seizoen kwam hij geen minuut aan spelen toe, maar in het tussenseizoen vertrok eerste doelman Silvio Proto naar KV Oostende en werd Davy Roef eerste doelman, waarop Boeckx een contractverlenging kreeg en tweede doelman werd. Roef beging echter een paar blunders, waardoor Boeckx plots het vertrouwen kreeg als eerste doelman van trainer René Weiler.
Frank Boeckx werd op 18 mei 2017 kampioen met Anderlecht na een 1-3 overwinning op het veld van Charleroi.
.svg){kind=small}
RSC Anderlecht
