GRIN2A: verschil tussen versies

Verwijderde inhoud Toegevoegde inhoud

In de regel

Versie van 24 okt 2023 16:20

Mee bezig

Aan dit artikel of deze sectie wordt de komende uren of dagen nog druk gewerkt.
Klik op geschiedenis voor de laatste ontwikkelingen.

GRIN2A (glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A)^[1], ook bekend als LKS, EPND, FESD, NR2A, GluN2A, NMDAR2A, is een proteïne dat bij mensen wordt gecodeerd door het GRIN2A-gen.^[2] Met 1464 aminozuren is de normale, proteïne-isovorme GluN2A-subeenheid groot. De korte GluN2A isovormen die specifiek zijn voor primaten worden gevormd door alternatieve splicing en bevatten 1281 aminozuren.^[3]^[4]

Functie

Het eiwit dat door dit gen wordt gecodeerd is een subeenheid van de N-methyl-D-aspartaatreceptoren, die heteroisomere eiwitcomplexen zijn met meerdere subeenheden voor het vormen van een ionotrope receptor. Deze subeenheden spelen een sleutelrol in de synaptische plasticiteit, waarvan wordt aangenomen dat ze ten grondslag liggen aan het geheugen en het leren.

Genetische associatie

Genetische associaties:
Varianten van het gen worden in verband gebracht met het beschermende effect van koffie op de ziekte van Parkinson.^[5]^[6]

Mutaties in GRIN2A worden in verband gebracht met drugs-resistante epilepsie.^[7]

Hele exoom/genoomsequencing (exoom=alle exons van een genoom) heeft geleid tot de ontdekking van een verband tussen mutaties in GRIN2A en een grote verscheidenheid aan neurologische ziekten, waaronder epilepsie, verstandelijke beperking, autismespectrumstoornissen, ontwikkelingsachterstand en schizofrenie.^[8]

Bronnen

Bronnen, noten en/of referenties

↑ Entrez Gene: GRIN2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A.
↑ Kalsi G, Whiting P, Bourdelles BL, Callen D, Barnard EA, Gurling H (February 1998). Localization of the human NMDAR2D receptor subunit gene (GRIN2D) to 19q13.1-qter, the NMDAR2A subunit gene to 16p13.2 (GRIN2A), and the NMDAR2C subunit gene (GRIN2C) to 17q24-q25 using somatic cell hybrid and radiation hybrid mapping panels. Genomics 47 (3): 423–425. PMID 9480759. DOI: 10.1006/geno.1997.5132.
↑ Warming H, Pegasiou CM, Pitera AP, Kariis H, Houghton SD, Kurbatskaya K, Ahmed A, Grundy P, Vajramani G, Bulters D, Altafaj X, Deinhardt K, Vargas-Caballero M (July 2019). A primate-specific short GluN2A-NMDA receptor isoform is expressed in the human brain. Molecular Brain 12 (1): 64. PMID 31272478. PMC 6610962. DOI: 10.1186/s13041-019-0485-9.
↑ Herbrechter R, Hube N, Buchholz R, Reiner A (July 2021). Splicing and editing of ionotropic glutamate receptors: a comprehensive analysis based on human RNA-Seq data. Cellular and Molecular Life Sciences 78 (14): 5605–5630. PMID 34100982. PMC 8257547. DOI: 10.1007/s00018-021-03865-z.
↑ Hamza TH, Chen H, Hill-Burns EM, Rhodes SL, Montimurro J, Kay DM, Tenesa A, Kusel VI, Sheehan P, Eaaswarkhanth M, Yearout D, Samii A, Roberts JW, Agarwal P, Bordelon Y, Park Y, Wang L, Gao J, Vance JM, Kendler KS, Bacanu SA, Scott WK, Ritz B, Nutt J, Factor SA, Zabetian CP, Payami H (August 2011). Genome-wide gene-environment study identifies glutamate receptor gene GRIN2A as a Parkinson's disease modifier gene via interaction with coffee. PLOS Genetics 7 (8): e1002237. PMID 21876681. PMC 3158052. DOI: 10.1371/journal.pgen.1002237.
↑ (June 2014). Caffeine interaction with glutamate receptor gene GRIN2A: Parkinson's disease in Swedish population. PLOS ONE 9 (6): e99294. PMID 24915238. PMC 4051678. DOI: 10.1371/journal.pone.0099294.
↑ Venkateswaran S, Myers KA, Smith AC, Beaulieu CL, Schwartzentruber JA, Majewski J, Bulman D, Boycott KM, Dyment DA (July 2014). Whole-exome sequencing in an individual with severe global developmental delay and intractable epilepsy identifies a novel, de novo GRIN2A mutation. Epilepsia 55 (7): e75–e79. PMID 24903190. DOI: 10.1111/epi.12663.
↑ Yuan H, Low CM, Moody OA, Jenkins A, Traynelis SF (July 2015). Ionotropic GABA and Glutamate Receptor Mutations and Human Neurologic Diseases. Molecular Pharmacology 88 (1): 203–217. PMID 25904555. PMC 4468639. DOI: 10.1124/mol.115.097998.

[entrez-1] Entrez Gene: GRIN2A glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A.

[pmid9480759-2] Kalsi G, Whiting P, Bourdelles BL, Callen D, Barnard EA, Gurling H (February 1998). Localization of the human NMDAR2D receptor subunit gene (GRIN2D) to 19q13.1-qter, the NMDAR2A subunit gene to 16p13.2 (GRIN2A), and the NMDAR2C subunit gene (GRIN2C) to 17q24-q25 using somatic cell hybrid and radiation hybrid mapping panels. Genomics 47 (3): 423–425. PMID 9480759. DOI: 10.1006/geno.1997.5132.

[3] Warming H, Pegasiou CM, Pitera AP, Kariis H, Houghton SD, Kurbatskaya K, Ahmed A, Grundy P, Vajramani G, Bulters D, Altafaj X, Deinhardt K, Vargas-Caballero M (July 2019). A primate-specific short GluN2A-NMDA receptor isoform is expressed in the human brain. Molecular Brain 12 (1): 64. PMID 31272478. PMC 6610962. DOI: 10.1186/s13041-019-0485-9.

[4] Herbrechter R, Hube N, Buchholz R, Reiner A (July 2021). Splicing and editing of ionotropic glutamate receptors: a comprehensive analysis based on human RNA-Seq data. Cellular and Molecular Life Sciences 78 (14): 5605–5630. PMID 34100982. PMC 8257547. DOI: 10.1007/s00018-021-03865-z.

[5] Hamza TH, Chen H, Hill-Burns EM, Rhodes SL, Montimurro J, Kay DM, Tenesa A, Kusel VI, Sheehan P, Eaaswarkhanth M, Yearout D, Samii A, Roberts JW, Agarwal P, Bordelon Y, Park Y, Wang L, Gao J, Vance JM, Kendler KS, Bacanu SA, Scott WK, Ritz B, Nutt J, Factor SA, Zabetian CP, Payami H (August 2011). Genome-wide gene-environment study identifies glutamate receptor gene GRIN2A as a Parkinson's disease modifier gene via interaction with coffee. PLOS Genetics 7 (8): e1002237. PMID 21876681. PMC 3158052. DOI: 10.1371/journal.pgen.1002237.

[6] (June 2014). Caffeine interaction with glutamate receptor gene GRIN2A: Parkinson's disease in Swedish population. PLOS ONE 9 (6): e99294. PMID 24915238. PMC 4051678. DOI: 10.1371/journal.pone.0099294.

[7] Venkateswaran S, Myers KA, Smith AC, Beaulieu CL, Schwartzentruber JA, Majewski J, Bulman D, Boycott KM, Dyment DA (July 2014). Whole-exome sequencing in an individual with severe global developmental delay and intractable epilepsy identifies a novel, de novo GRIN2A mutation. Epilepsia 55 (7): e75–e79. PMID 24903190. DOI: 10.1111/epi.12663.

[YuanLow2015-8] Yuan H, Low CM, Moody OA, Jenkins A, Traynelis SF (July 2015). Ionotropic GABA and Glutamate Receptor Mutations and Human Neurologic Diseases. Molecular Pharmacology 88 (1): 203–217. PMID 25904555. PMC 4468639. DOI: 10.1124/mol.115.097998.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

@@ Regel 5: / Regel 5: @@
 == Functie ==
 Het eiwit dat door dit gen wordt gecodeerd is een subeenheid van de [[NMDA-receptor|N-methyl-D-aspartaatreceptoren]], die [[Isomeer|heteroisomere]] eiwitcomplexen zijn met meerdere subeenheden voor het vormen van een [[ionotrope receptor]]. Deze subeenheden spelen een sleutelrol in de [[synaptische plasticiteit]], waarvan wordt aangenomen dat ze ten grondslag liggen aan het geheugen en het leren.
+== Genetische associatie ==
+[[Genetische associatie]]s:</br>
+Varianten van het gen worden in verband gebracht met het beschermende effect van [[Koffie (drank)#Cafeïne|koffie]] op de [[ziekte van Parkinson]].<ref>{{cite journal | author = Hamza TH, Chen H, Hill-Burns EM, Rhodes SL, Montimurro J, Kay DM, Tenesa A, Kusel VI, Sheehan P, Eaaswarkhanth M, Yearout D, Samii A, Roberts JW, Agarwal P, Bordelon Y, Park Y, Wang L, Gao J, Vance JM, Kendler KS, Bacanu SA, Scott WK, Ritz B, Nutt J, Factor SA, Zabetian CP, Payami H | display-authors = 6 | title = Genome-wide gene-environment study identifies glutamate receptor gene GRIN2A as a Parkinson's disease modifier gene via interaction with coffee | journal = PLOS Genetics | volume = 7 | issue = 8 | pages = e1002237 | date = August 2011 | pmid = 21876681 | pmc = 3158052 | doi = 10.1371/journal.pgen.1002237 }}</ref><ref>{{cite journal | vauthors = Yamada-Fowler N, Fredrikson M, Söderkvist P | title = Caffeine interaction with glutamate receptor gene GRIN2A: Parkinson's disease in Swedish population | journal = PLOS ONE | volume = 9 | issue = 6 | pages = e99294 | date = June 2014 | pmid = 24915238 | pmc = 4051678 | doi = 10.1371/journal.pone.0099294 | doi-access = free | bibcode = 2014PLoSO...999294Y }}</ref>
+Mutaties in GRIN2A worden in verband gebracht met drugs-resistante [[epilepsie]].<ref>{{cite journal | author = Venkateswaran S, Myers KA, Smith AC, Beaulieu CL, Schwartzentruber JA, Majewski J, Bulman D, Boycott KM, Dyment DA | display-authors = 6 | title = Whole-exome sequencing in an individual with severe global developmental delay and intractable epilepsy identifies a novel, de novo GRIN2A mutation | journal = Epilepsia | volume = 55 | issue = 7 | pages = e75–e79 | date = July 2014 | pmid = 24903190 | doi = 10.1111/epi.12663 | s2cid = 205116246 | doi-access = free }}</ref>
+Hele exoom/genoom[[sequencing]] (exoom=alle [[exon]]s van een [[genoom]]) heeft geleid tot de ontdekking van een verband tussen mutaties in GRIN2A en een grote verscheidenheid aan neurologische ziekten, waaronder [[epilepsie]], [[verstandelijke beperking]], [[autisme]]spectrumstoornissen, [[ontwikkelingsachterstand]] en [[schizofrenie]].<ref name="YuanLow2015">{{cite journal | author = Yuan H, Low CM, Moody OA, Jenkins A, Traynelis SF | title = Ionotropic GABA and Glutamate Receptor Mutations and Human Neurologic Diseases | journal = Molecular Pharmacology | volume = 88 | issue = 1 | pages = 203–217 | date = July 2015 | pmid = 25904555 | pmc = 4468639 | doi = 10.1124/mol.115.097998 }}</ref>
 == Bronnen ==