Çipi begon zijn carrière in eigen land bij KS Flamurtari Vlorë. In december 1998 trok hij voor het eerst naar het buitenland, naar het SloveenseNK Maribor. In het seizoen 1999/00 haalde hij met Maribor de Champions League-groepsfase na in de kwalificatierondes KRC Genk en Olympique Lyon te hebben uitgeschakeld. Cipi kwam op de radar van Genk te staan, maar de verdediger paste niet in de plannen van toenmalig trainer Johan Boskamp en tekende in 2000 uiteindelijk bij AA Gent.[1][2][3]
In het seizoen 2001/02 kwam Cipi vanwege aanhoudend blessureleed minder aan spelen toe bij AA Gent. Na drie seizoenen bij AA Gent stapte Cipi over naar de Duitse neo-eersteklasser Eintracht Frankfurt, dat 125.000 euro betaalde voor de verdediger.[8] De transfer van Cipi naar Frankfurt werd allesbehalve een voltreffer: na een half seizoen stapte hij al over naar Rot-Weiß Oberhausen, waar hij ook maar zes maanden bleef. In de zomer van 2004 leek Çipi op weg naar FC Brussels, maar de deal sprong uiteindelijk af.[9] Hij trok uiteindelijk naar SK Tirana, waar hij in 2007 zijn spelerscarrière afsloot.