Naast het feit dat Ceni een degelijke doelman is die bekendstond om zijn reflexen en het stoppen van strafschoppen, is hij ook de keeper met de meeste doelpunten op zijn naam. Op 20 augustus 2006 scoorde hij in de Braziliaanse competitie tegen Cruzeiro uit een vrije trap zijn 63e goal, waarmee hij José Luis Chilavert passeerde, die tot 62 doelpunten kwam gedurende zijn loopbaan. Opmerkelijk was dat dit doelpunt viel, enkele minuten nadat Cruzeiro een penalty gestopt zag worden door dezelfde Rogerio Ceni, hetgeen dus tot 0-3 had kunnen leiden. Later in dezelfde wedstrijd scoorde Ceni zelf nogmaals, nu uit een strafschop (zijn 64e) waardoor de wedstrijd in 2-2 eindigde.
Zijn eerste doelpunt maakte hij op 15 februari1997. Het record van meest benutte strafschoppen is ook in handen van Ceni. Voorheen stond dat op naam van René Higuita, de excentrieke Colombiaanse doelman die in zijn loopbaan 37 strafschoppen wist te verzilveren.
Eind 2007 is Ceni in Rio de Janeiro voor de tweede keer op rij gehuldigd als 'Speler van het Jaar' in de Braziliaanse voetbalcompetitie (Campeonato Brasileiro). De doelman werd dat seizoen met zijn club São Paulo tevens voor het tweede opeenvolgende jaar landskampioen. Daarbij had hij met 19 tegentreffers het minste aantal tegendoelpunten. Rogerio Ceni heeft op 27 maart 2011 een mijlpaal bereikt door zijn 100e doelpunt te scoren uit een vrije trap. In december 2015 beëindigde hij zijn carrière, met uiteindelijk meer dan 1200 officiële wedstrijden en 132 doelpunten. Hij staat nog steeds in de top tien van topschutters aller tijden voor de club, een unicum voor een doelman. In 2017 was Ceni enkele maanden hoofdtrainer van São Paulo FC.