Stikstofwortelknolletje: verschil tussen versies

Uit Wikipedia, de vrije encyclopedie
Verwijderde inhoud Toegevoegde inhoud
Geen bewerkingssamenvatting
Geen bewerkingssamenvatting
Regel 3: Regel 3:
[[Bestand:Closeup of a Dissected Medicago Root Nodule 1.JPG|thumb|Doorsnede van een stikstofknolletje op [[rupsklaver]] door ''[[Sinorhizobium meliloti]]'']]
[[Bestand:Closeup of a Dissected Medicago Root Nodule 1.JPG|thumb|Doorsnede van een stikstofknolletje op [[rupsklaver]] door ''[[Sinorhizobium meliloti]]'']]
[[Bestand:Root-nodule01.jpg|thumb|upright=1.25|right|Dwarsdoorsnede door een stikstofwortelknolletje bij [[Sojaboon|soja]] met de bacterie, ''[[Bradyrhizobium japonicum]]''. Deze afbeelding met grote vergroting toont een deel van een cel met enkele bacteriën in hun [[symbiosoom|symbiosomen]]. Verder zijn het [[endoplasmatisch reticulum]], [[golgicomplex]] en de [[celwand]] te zien.]]
[[Bestand:Root-nodule01.jpg|thumb|upright=1.25|right|Dwarsdoorsnede door een stikstofwortelknolletje bij [[Sojaboon|soja]] met de bacterie, ''[[Bradyrhizobium japonicum]]''. Deze afbeelding met grote vergroting toont een deel van een cel met enkele bacteriën in hun [[symbiosoom|symbiosomen]]. Verder zijn het [[endoplasmatisch reticulum]], [[golgicomplex]] en de [[celwand]] te zien.]]
[[Bestand: An alder root nodule gall.JPG|thumb|Stikstofwortelknolletjes bij els]]

'''Stikstofwortelknolletjes''' komen voor op de [[wortel (plant)|wortels]] van voornamelijk [[vlinderbloemigen|vlinderbloemige]] planten. De wortelknolletjes worden gevormd onder invloed van [[heterotroof|heterotrofe]] bacteriën uit onder andere het geslacht ''[[Rhizobium]]'', die in deze knolletjes in [[symbiose]] met de plant leven.<ref>{{cite journal | author =Wang, Qi| author2 = Yang, Shengming| last-author-amp = yes | title = Host-secreted antimicrobial peptide enforces symbiotic selectivity in Medicago truncatula | journal = PNAS | volume = 114 | issue = 26| pages = 6854–6859 | date = 2017 | doi = 10.1073/pnas.1700715114| pmid = 28607058| pmc = 5495241}}</ref> Ze [[stikstoffixatie|leggen]] voor deze planten de [[distikstof|stikstof]] (N<sub>2</sub>) uit de [[lucht]] vast met behulp van [[nitrogenase]] in [[ammoniak]] (NH<sub>3</sub>). Het ammoniak wordt, door andere soorten vrij levende bodembacteriën, via zogeheten [[nitrificatie]] verder omgezet in de stikstofverbinding [[nitraat]], die de plant, opgelost in [[bodemvocht]], via zijn wortels kan opnemen. De [[heterotroof|heterotrofe]] bacteriën betrekken hun [[chemische energie|energie]] uit [[glucose]] die de plant tijdens de [[fotosynthese]] [[assimilatie (biochemie)|assimileert]]. [[Appelzuur]] als afbraakproduct van glucose is de directe koolstofbron voor de bacterie. De stikstoffixatie in het wortelknolletje is zeer zuurstofgevoelig. Peulvruchtenwortelknolletjes bevatten het ijzerhoudend eiwit [[leghemoglobine]], nauw verwant aan het dierlijke [[myoglobine]], om de diffusie van zuurstofgas gebruikt bij de ademhaling te vergemakkelijken.
'''Stikstofwortelknolletjes''' komen voor op de [[wortel (plant)|wortels]] van voornamelijk [[vlinderbloemigen|vlinderbloemige]] planten. De wortelknolletjes worden gevormd onder invloed van [[heterotroof|heterotrofe]] bacteriën uit onder andere het geslacht ''[[Rhizobium]]'', die in deze knolletjes in [[symbiose]] met de plant leven.<ref>{{cite journal | author =Wang, Qi| author2 = Yang, Shengming| last-author-amp = yes | title = Host-secreted antimicrobial peptide enforces symbiotic selectivity in Medicago truncatula | journal = PNAS | volume = 114 | issue = 26| pages = 6854–6859 | date = 2017 | doi = 10.1073/pnas.1700715114| pmid = 28607058| pmc = 5495241}}</ref> Ze [[stikstoffixatie|leggen]] voor deze planten de [[distikstof|stikstof]] (N<sub>2</sub>) uit de [[lucht]] vast met behulp van [[nitrogenase]] in [[ammoniak]] (NH<sub>3</sub>). Het ammoniak wordt, door andere soorten vrij levende bodembacteriën, via zogeheten [[nitrificatie]] verder omgezet in de stikstofverbinding [[nitraat]], die de plant, opgelost in [[bodemvocht]], via zijn wortels kan opnemen. De [[heterotroof|heterotrofe]] bacteriën betrekken hun [[chemische energie|energie]] uit [[glucose]] die de plant tijdens de [[fotosynthese]] [[assimilatie (biochemie)|assimileert]]. [[Appelzuur]] als afbraakproduct van glucose is de directe koolstofbron voor de bacterie. De stikstoffixatie in het wortelknolletje is zeer zuurstofgevoelig. Peulvruchtenwortelknolletjes bevatten het ijzerhoudend eiwit [[leghemoglobine]], nauw verwant aan het dierlijke [[myoglobine]], om de diffusie van zuurstofgas gebruikt bij de ademhaling te vergemakkelijken.


Bij bomen, zoals bij [[Els (geslacht)|elzen]] vindt stikstofbinding plaats door de ''[[Frankia alni]]''-bacteriën.
Bij bomen, zoals bij [[Els (geslacht)|elzen]] vindt stikstofbinding plaats door de ''[[Frankia alni]]''-bacteriën.


Het [[zaaizaad]] van [[Sojaboon|soja]] wordt geïnoculeerd met de stikstofbindende bacterie ''[[Bradyrhizobium japonicum]]'' als deze bacterie van nature niet in de grond aanwezig is. Wat het geval is bij de grond in Nederland.

Een hoog stikstofgehalte in de grond blokkeert de ontwikkeling van de wortelknolletjes, omdat de plant er dan geen voordeel van heeft de symbiose aan te gaan.

== Reactievergelijkingen ==
De door nitrogenase gekatalyseerde gesommeerde reactie is:
De door nitrogenase gekatalyseerde gesommeerde reactie is:
: N<sub>2</sub> + 8H<sup>+</sup> + 8e<sup>−</sup> + 16 ATP → 2NH<sub>3</sub> + H<sub>2</sub> + 16ADP + 16 P<sub>i</sub>
: N<sub>2</sub> + 8H<sup>+</sup> + 8e<sup>−</sup> + 16 ATP → 2NH<sub>3</sub> + H<sub>2</sub> + 16ADP + 16 P<sub>i</sub>
Eerste stap van ammoniak naar nitriet
:<chem>2 NH3 + 3 O2 -> 2 H^+ + 2 NO2^- + 2 H2O</chem> <small>+ energie (ΔG°' = −235 [[Kilojoule|kJ]]/[[Mol (eenheid)|mol]])</small>
[[Hydroxylamine]] (<chem>NH2OH</chem>) is een intermediair in dit proces. De vorming van <chem>H^+</chem> geeft aan dat nitrificatie een verzurend proces is.


Tweede stap van nitriet naar nitraat
Het [[zaaizaad]] van [[Sojaboon|soja]] wordt geïnoculeerd met de stikstofbindende bacterie ''[[Bradyrhizobium japonicum]]'' als deze bacterie van nature niet in de grond aanwezig is. Wat het geval is bij de grond in Nederland.
:<chem>2 NO2^- + O2 -> 2 NO3^-</chem> <small>+ energie (ΔG°' = −76 kJ/mol)</small>


Totaalvergelijking:
Een hoog stikstofgehalte in de grond blokkeert de ontwikkeling van de wortelknolletjes, omdat de plant er dan geen voordeel van heeft de symbiose aan te gaan.
:<chem>2 NH3 + 4 O2 -> 2 H3O^+ + 2 NO3^-</chem> <small>+ energie</small>

== Soorten stikstofwortelknolletjes ==
'''Onbepaalde stikstofwortelknolletjes''' komen bij de meeste peulvruchten van de onderfamilies, ''[[Caesalpinioideae]]'', ''[[Faboideae]]'' en ''[[Mimosoideae]]'' voor, zowel in de gematigde gebieden als in de tropen. Ze komen voor bij de ''Faboideae'', zoals ''[[Pisum]]'' ([[erwt]]), ''[[Rupsklaver|Medicago]]'' (lucerne), ''[[Klaver (plant)|Trifolium]]'' (klaver) en ''[[Vicia]]'' (wikke en [[tuinboon]]) en alle ''Mimosoideae'' peulvruchten zoals ''[[acacia]]''s, de enkelen ''Caesalpinioideae'', zoals ''[[Chamaecrista fasciculata]]''. Ze worden "onbepaald" genoemd, omdat ze een actief apicaal [[meristeem]] behouden, die nieuwe cellen produceert gedurende de levensduur van het stikstofwortelknolletje. Hierdoor heeft het stikstofwortelknolletje meestal een cilindrische vorm met soms uitgebreide vertakkingen.<ref name="Sprent" /> Doordat ze actief blijven groeien zijn er in het weefsel zone's te zien door de verschillende stadia van ontwikkeling/symbiose:<ref>{{cite journal | title = Cell cycle regulation in the course of nodule organogenesis in ''Medicago'' | author = Fabrice Foucher | author2 = Eva Kondorosi | last-author-amp = yes | journal = Plant Molecular Biology | date = 2000 | volume = 43 | pages = 773–786 | pmid = 11089876 | doi = 10.1023/A:1006405029600 | issue = 5–6}}</ref><ref>{{cite journal | title = Architecture of Infection Thread Networks in Developing Root Nodules Induced by the Symbiotic Bacterium ''Sinorhizobium meliloti'' on ''Medicago truncatula'' | author = Hannah Monahan-Giovanelli | author2 = Catalina Arango Pinedo | author3 = Daniel J. Gage | last-author-amp = yes | journal = Plant Physiology | date = 2006 | volume = 140| pages = 661–670 | doi = 10.1104/pp.105.072876 | pmid = 16384905 | issue = 2 | pmc = 1361332}}</ref><ref>{{cite journal | title = Aging in Legume Symbiosis. A Molecular View on Nodule Senescence in ''Medicago truncatula'' | display-authors = 4 | author = Willem Van de Velde | author2 = Juan Carlos Pérez Guerra | author3 = Annick De Keyser | author4 = Riet De Rycke | author5 = Stéphane Rombauts | author6 = Nicolas Maunoury | author7 = Peter Mergaert | author8 = Eva Kondorosi | author9 = Marcelle Holsters | author10 = Sofie Goormachtig | last-author-amp = yes | journal = Plant Physiology Review | date = 2006 | volume = 141 | pages = 711–20 | doi = 10.1104/pp.106.078691 | pmid = 16648219 | issue = 2 | pmc = 1475454}}</ref>
[[Bestand:Indeterminate Nodule Zones Diagram.svg|left|thumb| Diagram met de verschillende zones van een onbepaald stikstofwortelknolletje (zie tekst).]]
: Zone I - het '''actieve meristeem'''. Dit is waar nieuw weefsel wordt gevormd, dat later zal differentiëren in de andere zones van het stikstofwortelknolletje.
: Zone II - de '''infectiezone'''. In deze zone komen infectiedraden vol met bacteriën voor. De plantencellen zijn groter dan in de vorige zone en de celdeling is gestopt.
:: Interzone II – III — Hier zijn de bacteriën de plantencellen binnengedrongen, die [[amyloplast]]en bevatten. Ze verlengen en beginnen terminaal te differentiëren in symbiotische, stikstofbindende [[Symbiosome|bacteriën]].
: Zone III — de '''stikstofbindingszone'''. Elke cel in deze zone bevat een grote, centrale [[vacuole]] en het [[cytoplasma]] is gevuld met volledig gedifferentieerde bacteriën die actief de stikstof binden. De plant voorziet deze cellen van leghemoglobine, waardoor ze een opvallende roze kleur hebben.
: Zone IV — de '''verouderingszone'''. Hier worden plantencellen met hun bacteriën afgebroken. De verdeling van de heemcomponent van leghemoglobine resulteert in een zichtbare vergroening aan de basis van het stikstofwortelknolletje. Dit is het meest bestudeerde type stikstofwortelknolletje, maar de details zijn behoorlijk verschillend tussen stikstofwortelknolletje van pinda en verwanten en sommige andere belangrijke gewassen zoals lupines waar het stikstofwortelknolletje gevormd wordt direct na infectie van de Rhizobium-bacterie via de [[epidermis]] van de plant en waarbij geen infectiedraden worden gevormd. De stikstofwortelknolletjes groeien rond de wortel en vormen een kraagachtige structuur. In deze stikstofwortelknolletjes en in het pindatype is het centrum van het geïnfecteerde weefsel uniform, waarbij niet-geïnfecteerde cellen ontbreken, maar die wel worden gevonden in stikstofwortelknolletjes van sojabonen en vele andere soorten zoals erwten en klavers.


{{Appendix}}
{{Appendix}}

Versie van 1 okt 2019 09:32

Mee bezig Mee bezig
Aan dit artikel of deze sectie wordt de komende uren of dagen nog druk gewerkt.
Klik op geschiedenis voor de laatste ontwikkelingen.
Stikstofwortelknolletjes bij tuinboon
Doorsnede van een stikstofknolletje op rupsklaver door Sinorhizobium meliloti
Dwarsdoorsnede door een stikstofwortelknolletje bij soja met de bacterie, Bradyrhizobium japonicum. Deze afbeelding met grote vergroting toont een deel van een cel met enkele bacteriën in hun symbiosomen. Verder zijn het endoplasmatisch reticulum, golgicomplex en de celwand te zien.
Stikstofwortelknolletjes bij els

Stikstofwortelknolletjes komen voor op de wortels van voornamelijk vlinderbloemige planten. De wortelknolletjes worden gevormd onder invloed van heterotrofe bacteriën uit onder andere het geslacht Rhizobium, die in deze knolletjes in symbiose met de plant leven.[1] Ze leggen voor deze planten de stikstof (N2) uit de lucht vast met behulp van nitrogenase in ammoniak (NH3). Het ammoniak wordt, door andere soorten vrij levende bodembacteriën, via zogeheten nitrificatie verder omgezet in de stikstofverbinding nitraat, die de plant, opgelost in bodemvocht, via zijn wortels kan opnemen. De heterotrofe bacteriën betrekken hun energie uit glucose die de plant tijdens de fotosynthese assimileert. Appelzuur als afbraakproduct van glucose is de directe koolstofbron voor de bacterie. De stikstoffixatie in het wortelknolletje is zeer zuurstofgevoelig. Peulvruchtenwortelknolletjes bevatten het ijzerhoudend eiwit leghemoglobine, nauw verwant aan het dierlijke myoglobine, om de diffusie van zuurstofgas gebruikt bij de ademhaling te vergemakkelijken.

Bij bomen, zoals bij elzen vindt stikstofbinding plaats door de Frankia alni-bacteriën.

Het zaaizaad van soja wordt geïnoculeerd met de stikstofbindende bacterie Bradyrhizobium japonicum als deze bacterie van nature niet in de grond aanwezig is. Wat het geval is bij de grond in Nederland.

Een hoog stikstofgehalte in de grond blokkeert de ontwikkeling van de wortelknolletjes, omdat de plant er dan geen voordeel van heeft de symbiose aan te gaan.

Reactievergelijkingen

De door nitrogenase gekatalyseerde gesommeerde reactie is:

N2 + 8H+ + 8e + 16 ATP → 2NH3 + H2 + 16ADP + 16 Pi

Eerste stap van ammoniak naar nitriet

+ energie (ΔG°' = −235 kJ/mol)

Hydroxylamine () is een intermediair in dit proces. De vorming van geeft aan dat nitrificatie een verzurend proces is.

Tweede stap van nitriet naar nitraat

+ energie (ΔG°' = −76 kJ/mol)

Totaalvergelijking:

+ energie

Soorten stikstofwortelknolletjes

Onbepaalde stikstofwortelknolletjes komen bij de meeste peulvruchten van de onderfamilies, Caesalpinioideae, Faboideae en Mimosoideae voor, zowel in de gematigde gebieden als in de tropen. Ze komen voor bij de Faboideae, zoals Pisum (erwt), Medicago (lucerne), Trifolium (klaver) en Vicia (wikke en tuinboon) en alle Mimosoideae peulvruchten zoals acacias, de enkelen Caesalpinioideae, zoals Chamaecrista fasciculata. Ze worden "onbepaald" genoemd, omdat ze een actief apicaal meristeem behouden, die nieuwe cellen produceert gedurende de levensduur van het stikstofwortelknolletje. Hierdoor heeft het stikstofwortelknolletje meestal een cilindrische vorm met soms uitgebreide vertakkingen.[2] Doordat ze actief blijven groeien zijn er in het weefsel zone's te zien door de verschillende stadia van ontwikkeling/symbiose:[3][4][5]

Diagram met de verschillende zones van een onbepaald stikstofwortelknolletje (zie tekst).
Zone I - het actieve meristeem. Dit is waar nieuw weefsel wordt gevormd, dat later zal differentiëren in de andere zones van het stikstofwortelknolletje.
Zone II - de infectiezone. In deze zone komen infectiedraden vol met bacteriën voor. De plantencellen zijn groter dan in de vorige zone en de celdeling is gestopt.
Interzone II – III — Hier zijn de bacteriën de plantencellen binnengedrongen, die amyloplasten bevatten. Ze verlengen en beginnen terminaal te differentiëren in symbiotische, stikstofbindende bacteriën.
Zone III — de stikstofbindingszone. Elke cel in deze zone bevat een grote, centrale vacuole en het cytoplasma is gevuld met volledig gedifferentieerde bacteriën die actief de stikstof binden. De plant voorziet deze cellen van leghemoglobine, waardoor ze een opvallende roze kleur hebben.
Zone IV — de verouderingszone. Hier worden plantencellen met hun bacteriën afgebroken. De verdeling van de heemcomponent van leghemoglobine resulteert in een zichtbare vergroening aan de basis van het stikstofwortelknolletje. Dit is het meest bestudeerde type stikstofwortelknolletje, maar de details zijn behoorlijk verschillend tussen stikstofwortelknolletje van pinda en verwanten en sommige andere belangrijke gewassen zoals lupines waar het stikstofwortelknolletje gevormd wordt direct na infectie van de Rhizobium-bacterie via de epidermis van de plant en waarbij geen infectiedraden worden gevormd. De stikstofwortelknolletjes groeien rond de wortel en vormen een kraagachtige structuur. In deze stikstofwortelknolletjes en in het pindatype is het centrum van het geïnfecteerde weefsel uniform, waarbij niet-geïnfecteerde cellen ontbreken, maar die wel worden gevonden in stikstofwortelknolletjes van sojabonen en vele andere soorten zoals erwten en klavers.
Zie de categorie Root nodules van Wikimedia Commons voor mediabestanden over dit onderwerp.